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四川专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺

来源: 发布时间:2022年11月07日

    h1)str分型;(h2)y-str分型;(h3)个体识别;(h4)亲权鉴定;(h5)种族推断。本发明还保护上述任一所述引物组合或上述任一所述复合扩增体系的应用,可为(h1)-(h5)中的至少一种:(h1)str分型;(h2)y-str分型;(h3)个体识别;(h4)亲权鉴定;(h5)种族推断。上述任一所述68个基因座具体可由amelogenin、dys19、dys385a/b、dyf387s1a/b、dys388、dys389-i、dys389-ii、dys390、dys391、dys392、dys393、dyf399s1、dyf404s1a/b、dys437、dys438、dys439、dys443、dys444、dys446、dys447、dys448、dys449、dys456、dys458、dys459a/b、dys460、dys481、dys485、dys504、dys505、dys508、dys510、dys518、dys520、dys522、dys527a/b、dys531、dys533、dys549、dys552、dys557、dys570、dys576、dys587、dys593、dys596、dys612、dys617、dys622、dys626、dys627、dys630、dys635、dys641、dys643、dys644、dys645、dys710、dys720、y-gata-a10和y-gata-h4组成。其中,amelogenin为性别决定基因座。dyf399s1包含三个分型片段。dys385a/b、dyf387s1a/b、dyf404s1a/b、dys459a/b和dys527a/b均包含两个分型片段。本发明提供的试剂盒可以检测68个基因座。PMS2抗体试剂 苏苏械备20180570号.四川专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺

    ⑦侧翼序列碱基数,各部分之间用tab键隔开。按照这种格式依次对68个基因座进行录入。68个基因座基因配置文件录入完成后,运行***。该文件给出了①基因座名称,②基因分型,③扩增子碱基数,④扩增子序列信息,⑤测序深度五个部分。根据国际法医遗传学会(internationalsocietyforforensicgenetics,isfg)发表的关于y-str基因座的str序列指南()和niststr数据库(strbase.)y染色体str情况说明对67个y-str基因座的序列构建**重复结构。实验结果见表3。结果表明,标准品2800m得到了完整的str分型,完全能够满足法医str检验的要求。表3-1注:n与其后数字表示一段碱基序列,其后数字表示序列的碱基数目。表3-2注:n与其后数字表示一段碱基序列,其后数字表示序列的碱基数目。二、采用实施例1制备的试剂盒的应用——口腔拭子样本的基因座分型样本一、样本二和样本三为3名汉族男性无关个体的口腔拭子的基因组dna,浓度均为1ng/μl。3名汉族男性均知情同意。将步骤一中的标准品2800m水溶液替换为样本一、样本二或样本三,其它步骤均不变。检测结果见表3。结果表明,样本一、样本二和样本三均获得了完整的str分型结果。 四川专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺迈杰转化医学利用新一代智能技术补充传统医学的检测模式,赋能医疗健康建设,更好地为临床和患者服务。

    吸弃上清。f.每孔加入100uL80%乙醇,静置30秒,吸弃上清。重复一遍。短时离心,吸弃上清。g.晾干3-5分钟,观察磁珠表面不再潮湿反光,成雾面状,可离开磁力架,每孔加入30uLNFW,吹打混匀重悬磁珠,室温孵育1分钟。h.孔板再次放上磁力架,等待2分钟,溶液澄清后,转移上清到新的孔板中。实施例3.多重PCR一、***轮多重PCRa.按照QubitdsDNAHSAssayKit操作手册检测样品浓度,根据Qubit检测的样本浓度,每个样品取同样的量(10ng),每5~10个样本混合在一起转移到新的孔板中。b.***轮特异性引物是普通的PCR扩增引物,共20个左右的碱基,Tm值设定在60℃,序列根据目标区域设计得到,多个引物混成一个OP引物池做为***轮PCR的上游引物。配置PCR总体系,按照理论值的125%配,震荡混匀,短时离心。c.孔板放入PCR仪中,选择MAPlex-1st程序运行2个小时。二、PCR产物纯化,取下孔板,打开盖子,每孔加入60uL的磁珠,吹打混匀,室温下孵育5分钟。b.将孔板或八联管放上磁力架,等待2分钟,溶液澄清后,吸弃上清。c.每孔加入100uL80%乙醇,静置30秒,吸弃上清。重复一遍。d.晾干3-5分钟,观察磁珠表面不再潮湿反光,成雾面状,可离开磁力架,每孔加入20uLNFW,吹打混匀重悬磁珠。

    本发明属于法医学技术领域,具体涉及基于二代测序技术检测68个基因座的试剂盒及其使用的引物组合,尤其涉及基于二代测序技术检测67个y-str基因座和amelogenin基因座的试剂盒及其使用的引物组合。背景技术:短串联重复(shorttandemrepeat,str)是由2~6bp重复单位串联组成且***存在于人类基因组中的一类具有长度多态性的dna序列,是目前法医个体识别和亲子鉴定应用*****的遗传标记。人类y染色体短串联重复(y-chromosomeshorttandemrepeats,y-str)具有父系遗传、缺乏重组、分型简单、信息量大、多态性高等特点,是研究人类的起源进化、民族差异、种族差异、群体及地区分布等的有力工具。因此,y染色体str基因座多态性研究可为法医学个体识别和亲权鉴定提供重要手段,在诸如父系家族的亲权鉴定、混合斑男性成分的检测、不同男性个体混合物的分析、追溯父系迁移历史及重构同一父系家族等方向都具有独特的应用价值。目前,荧光标记多重扩增结合毛细管电泳(fluorescentlabeledmultiplexpcr-capillaryelectrophoresis,pcr-ce)是str分型的主流技术;常用的商业化y-str分型试剂盒有y23(promega)、y(promega)、yfiler(thermofisherscientific)和yfilerplus。迈杰转化医学围绕生物标志物研究、伴随诊断开发,建立了完善的核酸组学、蛋白组学、细胞组学技术平台。

    连接测序法连接测序法与其他两种方法不同,因为他不用DNA聚合酶来结合核苷酸,而是用16种8-merOligo核苷酸探针,在相互连接的5端,每个探针都吸附了四种荧光染料其中的一种。每8-mer包含两个探针特异碱基,和6个退化碱基。测序反应开始时,引物先结合到适配序列上,再和相应探针结合。这个探针的结合时在退火条件下由两个探针特异碱基引导,再由DNA连接酶连接到引物序列上。未结合的oligo核苷酸被洗去后,荧光信号就开始检测会记录。在这之后,切割掉荧光信号和8-mer探针的***3个碱基,就可以开始下一个循环了。在大约7个循环的连接之后,DNA会变性,而另一个测序引物,在前一个引物的下一个碱基后开始重复这些步骤,总共用5个测序引物。这项技术的主要缺点就是产生的测序片段特别短。离子半导体测序离子半导体测序法时在测序反应种通过释放氢离子来检测一个基因蔟的序列。每个基因蔟直接定位在一个半导体三极管上,这个半导体三极管可以检测溶液的ph值。在核苷酸结合过程中,一个氢离子被释放到溶液中并会被半导体三极管检测到。这个测序反应的进行过程和焦磷酸法类似,但是花费只是他的几分之一。 迈杰转化医学蛋白免疫产品开发平台可提供基于IHC平台的体外诊断试剂盒以及蛋白抗体原料一站式开发服务。黑龙江多靶点迈杰转化医学NGS平台服务至上

MLH1抗体试剂 苏苏械备20180519号.四川专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺

    室温孵育1分钟。e.孔板再次放上磁力架,等待2分钟,溶液澄清后,转移上清到新的孔板中。三、第二轮多重PCRa.第二轮特异性引物是普通的PCR扩增引物,在其5’端加上测序接头5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3’共80个左右的碱基,其中根据目标区域设计得到的序列长度是20个碱基左右,Tm值设定在60℃,多个引物混成一个IP引物池做为第二轮PCR的上游引物。P7的序列:5’-CAAGCAGAAGACGGCATACGAG-3’。配置PCR总体系,按照理论值的125%配制,震荡混匀,短时离心。b.孔板放入PCR仪中,选择MAPlex-2nd程序运行2个小时。四、PCR产物纯化步骤同二,做两次纯化,彻底去除引物二聚体。***次使用28uL的磁珠纯化,用20uL的NFW洗脱;第二次用20uL的磁珠纯化,用25uL的NFW洗脱。五、电泳鉴定每个样品取5uL,进行%的琼脂糖电泳,观察是否有条带,以及条带长度是否在300-400bp之间。实施例5.文库定量与混合a.将标准品、荧光定量试剂、引物从-20℃取出放置于冰上融化。b.样品稀释10000倍,分两次梯度稀释。***次取文库原液2uL,加入198uL的NFW,振荡混匀或者用***吹打混匀,短时离心。再从中取出10uL,加入990uLNFW,振荡混匀或者用***吹打混匀,短时离心。四川专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺

迈杰转化医学按照ISO 13485和GMP要求,建立了覆盖全平台的产品研发实验室,用于产品研发。实验室能够开展抗体研发,PCR产品、NGS产品、病理产品以及产品化学发光的研发,同时建立了**的产品质检实验室和洁净质检实验室研发实验室已获的欧盟 ISO 13485 认证证书,满足IVD/CDx 产品研发要求,通过NMPA 质量体系考核。

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