聚合酶链式反应生物学研究的历史中占据了重要的地位。以此为基础发展出包括Real-time PCR在内的多项应用技术。自诞生后Real-time PCR技术持续发展,从简单的增扩到整个PCR过程,Real-time PCR表现出比PCR更敏感、更明确的定量分析特性和对识别等位基因的能力。不少人以为real-time就是意味着可以在显示器上看到每个循环增扩曲线的增长。事实并非如此,早期的软件不能在运行期间提供可视化的增扩曲线。主要是因为SDS软件采用整个平台较终的数据执行数据分析工作,而不是分析每个单独的反应循环。对某些设备来说,必须向分析软件提供实时的数据,有些设备则不需要。前一种设备允许软件实时跟踪每个加样口的增扩曲线,同时显示在电脑屏幕上。Real-time PCR探针法实验结果稳定重複性好,特异性更高。杭州骨头RT-PCR检测技术设计公司
Real-time PCR-传统定量PCR:1)内参照法:在不同的PCR反应管中加入已定量的内标和引物,内标用基因工程方法合成。上游引物用荧光标记,下游引物不标记。在模板扩增的同时,内标也被扩增。在PCR产物中,由于内标与靶模板的长度不同,二者的扩增产物可用电泳或高效液相分离开来,分别测定其荧光强度,以内标为对照定量待检测模板。2)竞争法:选择由突变克隆产生的含有一个新内切位点的外源竞争性模板。在同一反应管中,待测样品与竞争模板用同一对引物同时扩增(其中一个引物为荧光标记)。南京微量数字PCR供应商聚合酶链反应的这种能力增强了许多方法,例如生成杂交探针用于杂交。
Real-time PCR-传统定量PCR:扩增后用内切酶消化PCR产物,竞争性模板的产物被酶解为两个片段,而待测模板不被酶切,可通过电泳或高效液相将两种产物分开,分别测定荧光强度,根据已知模板推测未知模板的起始拷贝数。PCR-ELISA法:利用地高辛或生物素等标记引物,扩增产物被固相板上特异的探针所结合,再加入抗地高辛或生物素酶标抗体-辣根过氧化物酶结合物,之后酶使底物显色。常规的PCR-ELISA法只是定性实验,若加入内标,作出标准曲线,也可实现定量检测目的。
Real-time PCR的染料法和探针法的选择:进行mRNA表达量的测定,采用染料法是比较经济实惠的;染料法可以通过比较熔解曲线的熔解峰位置得到产物特异性的情况;目的基因和内参基因分管检测,染料法可以选用Realtime染料PCRPreMIX,探针法主要应用于病毒RNA的检测;以及单位点突变(SNP);多基因的合并检测,探针法还可用于同一个反应中同时检测目的基因和内参基因的情况;而染料法则必须分管检测。Real-time PCR:实时荧光定量PCR技术(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction简称Real-time PCR)是在定性PCR技术基础上发展起来的核酸定量技术。实时荧光定量在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,使每一个循环变得“可见”,之后通过Ct值和标准曲线对样品中的DNA(orcDNA)的起始浓度进行定量的方法。在PCR产物中,由于内标与靶模板的长度不同。
为了便于对所检测样本进行比较,在real-timeQ-PCR反应的指数期,首先需设定一定荧光信号的域值,一般这个域值(threshold)是以PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号(baseline),荧光域值的缺省设置是3~15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。如果检测到荧光信号超过域值被认为是真正的信号,它可用于定义样本的域值循环数(Ct)。Ct值的含义是:每个反应管内的荧光信号达到设定的域值时所经历的循环数。研究表明,每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,因此只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。PCR由一系列20-40次重复的温度变化组成,称为热循环。无锡骨头数字PCR
Real-time PCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。杭州骨头RT-PCR检测技术设计公司
实时定量PCR的系统构成及工作原理:荧光定量检测系统由实时荧光定量PCR仪,实时荧光定量试剂,通用电脑,自动分析软件等构成。设备由荧光定量系统和计算机组成,用来监测循环过程的荧光。与实时设备相连的计算机收集荧光数据。数据通过开发的实时分析软件以图表的形式显示。原始数据被绘制成荧光强度相对于循环数的图表。原始数据收集后可以开始分析。实时设备的软件能使收集到的数据进行正常化处理来弥补背景荧光的差异。正常化后可以设定域值水平,这就是分析荧光数据的水平。杭州骨头RT-PCR检测技术设计公司
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