聚合酶链式反应准备:PCR引物设计,PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。引物设计的基本原则:引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC很好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列参照。在不同的PCR反应管中加入已定量的内标和引物,内标用基因工程方法合成。莆田分子生物学荧光PCR
聚合酶链反应同时扩增单个精子中几个基因座的能力增强了极大地增强了通过研究减数分裂后染色体交叉来进行基因定位的传统任务。通过分析数千个单个精子,已经直接观察到非常紧密基因座之间罕见的交叉事件。类似地,可以分析异常的缺失、插入、易位或倒位,所有这些都无需等待(或支付)漫长而艰苦的受精、胚胎发生等过程。定点突变:聚合酶链反应可用于产生突变基因,突变由科学家随意选择。可以选择这些突变来理解蛋白质是如何完成其功能的,并改变或改善蛋白质功能。聚合酶链式反应的模板的取材主要依据PCR的扩增对象,可以是病原体标本如病毒、细菌、菌类等。广州分子生物学PCR检测技术服务聚合酶链反应是是一种简单,廉价和可靠的方法复制DN段。
引物的设计注意事项:1,引物设计要跨内含子,不能在一个外显子上(我们的实验是以cDNA为模板来扩增的,如果有DNA污染的话,因为DNA上含有分子量很大的内含子,不可能完成扩增。这对我们消除整个实验的误差起很大的作用)。2,引物设计的时候要尽可能设计在同一退火温度,方便于以后同时扩增很多不同的基因片段。但是如果相差比较大,就得分开做,浪费模板,浪费管家基因,所以每个实验室设计引物的时候要尽可能一致,这样就不用每次查退火温度,且对整个实验有利。
所谓real-timeQ-PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基因,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,之后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在real-time技术的发展过程中,两个重要的发现起着关键的作用:(1)TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的发现,它能降解特异性荧光记探针,因此使得间接的检测PCR产物成为可能。(2)此后荧光双标记探针的运用使在一密闭的反应管中能实时地监测反应全过程。这两个发现的结合以及相应的仪器和试剂的商品化发展导致real-timeQ-PCR方法在研究工作中的运用。聚合酶链反应允许快速生产短DN段,即使已知的引物序列不超过两个。
Real-time PCR:Ct值与起始模板的线性关系由于Ct值与起始模板的对数存在线性关系,可利用标准曲线对未知样品进行定量测定,因此,实时荧光定量PCR是一种采用外标准曲线定量的方法。外标准曲线的定量方法相比内标法是一种准确的、值得信赖的科学方法。利用外标准曲线的实时荧光定量PCR是迄今为止定量较准确,重现性较好的定量方法,已得到全世界的公认,普遍用于基因表达研究、转基因研究,药物疗效考核、病原体检测等诸多领域。实时荧光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有两种策略,相对定量和定量。使用Real-time PCR进行基因检测,被普遍应用于病毒和病原菌检测基因检测等领域。广州分子生物学PCR检测技术服务
PCR由一系列20-40次重复的温度变化组成,称为热循环。莆田分子生物学荧光PCR
内标在传统定量中的作用,由于传统定量方法都是终点检测,即PCR到达平台期后进行检测,而PCR经过对数期扩增到达平台期时,检测重现性极差。同一个模板在96孔PCR仪上做96次重复实验,所得结果有很大差异,因此无法直接从终点产物量推算出起始模板量。加入内标后,可部分消除终产物定量所造成的不准确性。但即使如此,传统的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。内标对定量PCR的影响,若在待测样品中加入已知起始拷贝数的内标,则PCR反应变为双重PCR,双重PCR反应中存在两种模板之间的干扰和竞争,尤其当两种模板的起始拷贝数相差比较大时,这种竞争会表现得更为明显。但由于待测样品的起始拷贝数是未知的,所以无法加入合适数量的已知模板作为内标。也正是这个原因,传统定量方法虽然加入内标,但仍然只是一种半定量的方法。莆田分子生物学荧光PCR
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