Real-time PCR探针法适用于:1、具有高适应性和可靠性,实验结果稳定重複性好,特异性更高。2、适用于扩增序列专一的体系的检测。3、样品中靶基因含量过低的定量PCR检测。4、靶基因的特异序列较短,无论怎样较佳化引物设计条件都不能解决。5、存在与靶基因同源的序列,在PCR中容易出现非特异性扩增,对特异性要求较高的定量。6、普遍用于人类传染病的诊断和病原定量,在动物病原体基因的检测,畜禽产品的检验检疫,生物製品的鉴定。Real-time PCR探针法:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的萤光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告萤光基团和一个淬灭萤光基团。探针完整时,报告基团发射的萤光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告萤光基团和淬灭萤光基团分离,从而萤光监测系统可接收到萤光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个萤光分子形成,实现了萤光信号的累积与PCR产物形成完全同步。Real-time PCR反应的一个主要限制是,为了产生其选择性扩增的引物,需要目标序列的先前信息。广州组织荧光PCR供应商
为了便于对所检测样本进行比较,在real-timeQ-PCR反应的指数期,首先需设定一定荧光信号的域值,一般这个域值(threshold)是以PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号(baseline),荧光域值的缺省设置是3~15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。如果检测到荧光信号超过域值被认为是真正的信号,它可用于定义样本的域值循环数(Ct)。Ct值的含义是:每个反应管内的荧光信号达到设定的域值时所经历的循环数。研究表明,每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,因此只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。上海分子生物学定量PCR哪家好流聚合酶链反应将溶液置于热梯度下,而不是反复加热和冷却聚合酶链反应混合物。
Real-time PCR原理:Real-time PCR主要指在PCR反应体系中加入荧光物质,然后通过荧光化学物质监测每次PCR反应循环后产物总量的方法,之后通过内参法或外参法对待测样品中的特定DNA序列(目的基因)进行定量分析的方法。实验过程中,这些荧光物质可以在激发光的作用下释放出一定波长的发射光,定量用PCR仪通过对这些发射光进行实时监测,较终可以描绘出整个PCR的反应过程,这就是Real-time PCR的原理。Real-time PCR链式反应:DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。但是,DNA聚合酶在高温时会失活。
Real-time PCR:Ct值与起始模板的线性关系由于Ct值与起始模板的对数存在线性关系,可利用标准曲线对未知样品进行定量测定,因此,实时荧光定量PCR是一种采用外标准曲线定量的方法。外标准曲线的定量方法相比内标法是一种准确的、值得信赖的科学方法。利用外标准曲线的实时荧光定量PCR是迄今为止定量较准确,重现性较好的定量方法,已得到全世界的公认,普遍用于基因表达研究、转基因研究,药物疗效考核、病原体检测等诸多领域。实时荧光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有两种策略,相对定量和定量。Real-time PCR技术即实时萤光定量PCR避免了传统PCR以终产物监测定量产生的偏差。
Real-timePCR的反应条件:dNTP浓度过高会加快反应速度,但同时还可以增加碱基的错误掺入率。引物浓度过高会引起错配和非特异性产物扩增。TaqDNA聚合酶浓度过高会引起错配和非特异性产物扩增,低则合成产物量减少。TaqDNA聚合酶无校正功能,掺入错误率达2*E-4个核苷酸,一个30个循环的扩增反应0.1%-0.25%总错误率。在90~95度下可使整个基因组的DNA变性为单链。一般94~95度30~60s。时间过长使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破坏增多。DNA很快冷却到40~60度使引物和模板结合。引物长度在15~25时退火温度。聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DN段的分子生物学技术。南京特殊样本荧光定量PCR技术服务
聚合酶链式反应可看作是生物体外的特殊DNA复制。广州组织荧光PCR供应商
Real-time PCR实验注意事项-防止RNA酶污染的措施:1.所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间。2.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)。3.有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3%H2O2室温10min,然后用0.1%DEPC水冲洗,晾干。4.配制的溶液应尽可能的用0.1%DEPC,在37℃处理12hr以上。然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22μm滤膜过滤除菌。5.操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。6.设置RNA操作专业使用实验室,所有器械等应为专业使用。广州组织荧光PCR供应商
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