Real-time PCR双荧光标记探针设计原则:具体的其他要求可以具体联系设计公司,拿到合成好的引物,需要先确认引物的性能。可以用这对引物先扩增梯度稀释后的标准品(标准品介绍见后续内容)。由不同梯度标准品的加量和其对应的Ct值,描绘出一条标准曲线。这里要注意根据标准曲线得到的参数是非常重要的。引物性能确认:1.决定系数R2大于0.98,越接近于1,结果越可靠。2.扩增效率一般要求在0.8-1.2,越接近于1,越好。3.检测的灵敏度,必须确认,通常要求35个循环以内,一般可以得到比较好的定量结果,30个循环以内,没有非特异性扩增产生。4.NTC是必须要确认的,通常要求30个循环内没有引物二聚体产生。聚合酶链式反应的模板的取材主要依据PCR的扩增对象。珠海骨头数字PCR网站
Real-time PCR链反应注意事项:在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照;内参的设定:主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免RNA定量误差、加样误差以及各PCR反应体系中扩增效率不均一各孔间的温度差等所造成的误差;PCR不能进入平台期,出现平台效应与所扩增的目的基因的长度、序列、二级结构以及目标DNA起始的数量有关。故对于每一个目标序列出现平台效应的循环数,均应通过单独实验来确定;防止DNA的污染:采用DNA酶处理RNA;在可能的情况下,将PCR引物置于基因的不同外显子,以消除基因和mRNA的共线性。南通分子生物学定量PCR原理及步骤Real-time PCR技术即实时萤光定量PCR避免了传统PCR以终产物监测定量产生的偏差。
Real-time PCR:使用Real-time PCR进行基因检测,被普遍应用于病毒和病原菌检测、转基因食品检测、遗传病基因检测等领域。一般首先需要利用专业使用的试剂盒从待检样品中提取其核酸(DNAorRNA),并经过精制等复杂的操作(通常称为前处理操作)之后才可以进行Real-time PCR。不易受反应阻害物的影响,使用时不需要进行复杂的前处理操作,单单需将待检样品直接加入到检测试剂中即可开始检测。通过使用本产品,可以在更短的时间内,简便、低成本地进行Real-time PCR检测。
Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的检测,转基因动植物转基因拷贝数的检测,RNAi基因失活率的检测等;2.基因表达差异分析:例如比较经过不同处理样本之间特定基因的表达差异(如药物处理、物理处理、化学处理等),特定基因在不同时相的表达差异以及cDNA晶片或差显结果的确证;3.基因分型:例如SNP检测,甲基化检测等。Real-time PCR常用的两种方法分别为Sybrgreen(萤光染料掺入法)和Taqmanprobe(探针法)。现在有些PCR因为扩增区很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的时间内复制完成。
Real-time PCR-传统定量PCR:扩增后用内切酶消化PCR产物,竞争性模板的产物被酶解为两个片段,而待测模板不被酶切,可通过电泳或高效液相将两种产物分开,分别测定荧光强度,根据已知模板推测未知模板的起始拷贝数。PCR-ELISA法:利用地高辛或生物素等标记引物,扩增产物被固相板上特异的探针所结合,再加入抗地高辛或生物素酶标抗体-辣根过氧化物酶结合物,之后酶使底物显色。常规的PCR-ELISA法只是定性实验,若加入内标,作出标准曲线,也可实现定量检测目的。PCR反应的特异性决定因素为:引物与模板DNA特异正确的结合。厦门组织定量PCR研究方案
聚合酶链式反应的引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%。珠海骨头数字PCR网站
Real-timePCR技术服务聚合酶链式反应的试验污染:实验室中克隆质粒的污染:在分子生物学实验室及某些用克隆质粒做阳性对照的检验室,这个问题也比较常见。因为克隆质粒在单位容积内含量相当高,另外在纯化过程中需用较多的用具及试剂,而且在活细胞内的质粒,由于活细胞的生长繁殖的简便性及具有很强的生命力。其污染可能性也很大。污染的监测:一个好的实验室,要时刻注意污染的监测,考虑有无污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。重复性试验。选择不同区域的引物进行PCR扩增。珠海骨头数字PCR网站
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