细胞RNA提取的方法:实验提取步骤:标准Trizol提取步骤为液氮研磨--加入Trizol裂解--加入氯仿抽提--离心--加入氯丙醇沉淀--离心--酒精洗涤--离心。将细胞培养皿置于冰上,加入Trizol裂解5-10分钟,用泵头轻轻吹打后吸取液体放入进口EP管中。加入1/5体积的氯仿,上下混匀液体,4度静置10-15分钟。(氯仿为有机溶剂,有效的使有机相和无机相迅速分离。有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和RNA脱离,RNA进入水相)。4度离心15分钟,一定注意选择低温离心。离心后分成三层,RNA在上清里,从离心机轻轻拿出EP管,以免管内物质震荡导致下层沉淀激起。吸取上清的时候一定要动作轻柔,切忌吸取太多,一般吸到400-500ul,避免吸到下层沉淀,将液体置于新的EP管中。加入等体积异丙醇,4度静置10min,然后12000rpm离心10min。试剂盒中的吸附柱采用特殊的硅基质膜材料。上海正规RNA提取试剂直销价
目前,主流的RNA提取方法有Trizol法、离心柱法和磁珠法。其中,Trizol法与离心柱法相比,提取效果相当,但因其对操作者带来的毒性,现在越来越被弃用。磁珠法可以针对大批量样本处理,适合机器自动化提取,但是提取核酸纯度低,提取得率低,且使用成本较高。对于拭子RNA含量较低的样本或比较珍贵的样本或样本总数不是很多的实验室,选择的拭子RNA提取方法应是离心柱法。近来,随着基因诊断技术的发展,从口腔拭子、泌尿生殖道拭子、痰液等样本中进行RNA提取的试剂盒的应用价值越来越大,如tumour早期诊断、遗传病检测和病原体传染核酸检测等。拭子RNA提取效果在很大程度上取决于采样质量、试剂盒性能等,特别是试剂盒的性能较大影响了拭子核酸的基因检测和各种研究的开展。上海正规RNA提取试剂直销价再采集样本之后马上加入 DNA/RNA Shield,可以快速降解掉 RNase 等蛋白物质。
RNA组成结构:RNA和DNA一样,也是由各种核苷酸通过3′,5′-磷酸二酯键连接构成的多核苷酸链,但与DNA有一系列差异。1.在化学组成方面,RNA含核糖而不含脱氧核糖。含尿嘧啶而不含胸腺密啶。例外的是,每个tNA分子含有一个胸腺嘧啶,这是在RNA链合成后由尿嘧啶甲基化生的,此外,前面已提到,少数DNA含有少量核糖,但这些个别的例外并不能以此否定两类核酸组成上的差异。2.RNA一级结构的概念虽与DNA相同.但其基本结构单位是核糖核苷酸而不是脱氧核糖核苷酸。此外,部分RNA5′端或3′端有特殊的核苷酸序列,而且RNA一级结构中没有DNA那样复杂的顺序组织。3.绝大多数RNA为单链分子,单链可自身折迭形成发夹(hairpin)样结构而有局部双螺旋结构的特征,这是各种RAN空间结构的共同特征。RNA局部双螺旋结构中碱基互补配对规律是A对U和G对C。由于RNA分子内部不能较全形成碱基配对,故其碱基克分子比A不等于U,G不等于C,不存在DNA碱基比例的Chargaff规律。
RNA提取试剂TRIpure是基于世界上使用较普遍的异硫氰酸胍/酚法研制而成的总RNA抽提试剂。在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性。无论是人、动物、植物还是细菌组织,该方法对少量的组织(50-100mg)和细胞(5×106)以及大量的组织(≥1g)和细胞(>107)均有较好的分离效果。TRIpure试剂操作上的简单性允许同时处理多个样品,所有的操作可以在一小时内完成。TRIpure抽提的总RNA能够避免DNA和蛋白的污染,故而能够作RNA印迹分析、斑点杂交、poly(A)+选择、体外翻译、RNA酶保护分析和分子克隆等。和进口品牌实验对照显示,公司的产品质量已经达到甚至超过了进口产品的质量~这种情况下,可以在裂解缓冲液中立即进行溶解。
动物细胞RNA提取:1、悬浮细胞:可直接离心后弃掉培养基,用无菌PBS清洗1~2遍后,再用适量PBS悬浮起来,然后再加入裂解液进行裂解。千万不要完全弃掉液体后,往沉淀细胞里直接加入裂解液,这样会使外表层的细胞裂解后释放的组蛋白包裹粘附在沉淀细胞外侧,从而限制沉淀内部的细胞与裂解液的接触,从而导致细胞裂解不彻底,降低RNA得率。2、半贴壁或贴壁不紧的细胞:弃掉培养基后,用PBS洗1~2次,然后直接吸取适量PBS用吸管或者泵吹打培养皿,把细胞吹下来,转移到无RNA酶的EP管中,加裂解液进行提取。3、贴壁细胞:需要先用胰酶消化,然后收集到无RNA酶的EP管中,离心去其上清,用PBS洗1~2次,去除多余的胰酶,以适量PBS重悬后继续进行提取步骤。可从全血,哺乳动物细胞,细菌细胞和菌类细胞中分离总RNA。上海正规RNA提取试剂直销价
RNA提取试剂注意事项:有机相用异丙醇沉淀可回收蛋白。上海正规RNA提取试剂直销价
RNA是核糖核酸,DNA是脱氧核酸。区别:紫外吸收:核酸的λm=260nm,碱基展开程度越大,紫外吸收就越厉害。当A=1时,DNA:50ug/ml,RNA和单链DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280还可来表示核酸的纯度。沉降速度:对于拓扑异构体(核苷酸数目相同的核酸),其沉降速度从达到小依次为:RNA;超螺旋DNA>解链环状DNA;松弛环状DNA;线形DNA也就是在离心管中较上层是线形DNA,较下面是RNA。电泳:核苷酸、核酸均可以进行电泳,泳动速度主要由分子大小来决定,因此,电泳是测定核酸分子量的好方法。DNA分子量测定较直接的方法:用适当浓度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以将其他形式的DNA变成线形DNA,用电镜测出其长度,按B-DNA模型算出bp数,根据核苷酸的平均分子量就可计算出DNA的分子量。上海正规RNA提取试剂直销价