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上海广东数字PCR如何选型

来源: 发布时间:2023年03月14日

与常规PCR方法相比,数字PCR有如下优势:1、能够***定量:常规PCR定量需要制定已知拷贝数的标准DNA曲线,但是由于待检样本与标准曲线不在统一体系,条件上会存在差异,另外加上PCR扩增效率的差异从而影响定量结果的准确性。而数字PCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可进行***定量。2、样本需求量低:适用于珍贵样本或核酸降解严重的样本。3、灵敏度高:数字PCR是将传统PCR反应体系分割成数万个 PCR反应,这些反应可以精确地检测很小的目的片段差异、单拷贝甚至低浓度的混杂样本。且能避免非同源异质双链的形成。4、高耐受性:由于目的序列被分配到多个 反应体系中,***降低了背景信号和***物对反应的干扰,扩增基质效应大大减小。基因表达差异的监测。上海广东数字PCR如何选型

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研究方向甲基化含量鉴定作为表观遗传学研究中重要的一个研究方向——甲基化程度分析,现阶段有不同的方法或技术来进行研究:如传统的亚硫酸氢盐处理后的克隆测序统计法、抗体检测法、定量PCR检测法等。这些方法皆因方法学的问题而不能获得精确的定量,而微滴式 数字PCR系统通过对样品的微滴化处理及目标因子的***拷贝数定量,为甲基化程度的精确定量检测提供了一种全新的技术。*****的伴随诊断常用体液来源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待检标本中的DNA,有正常脱落体细胞和病变脱落细胞两种来源,前者的量远大于后者。通过微液滴处理能在每个微液滴中有效减少正常体细胞DNA的干扰,实现**标记物的有效检测,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突变检测、乳腺*/胃*的HER2基因扩增检测等,应用于**精细医学的伴随诊断。上海广东数字PCR如何选型能检测低至0.01%的突变基因。

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定量PCR和数字PCR的特点:1.在20多年的使用和发展中,定量PCR作为一种技术平台,已经产出海量的数据,在工业界和分子检测的某些应用上,定量PCR已经成为“金标准”。基础研究方面,则形成了被称为MIQE的“定量PCR标准实验指南”。2.在定量PCR的各种应用中,基因表达分析(geneexpressionanalysis)的应用比重约占七成,综合各种因素来看,眼下定量PCR还是进行基因表达研究的理想手段。3.上述的“各种因素”具体展开,主要包括:通量、自动化程度、各种检测探针与染料、检测通道、成本和可参考文献与protocol的数目等等。4.就目前市场上已有的数字PCR设备来看,定量PCR在检测的线性范围上具有优势,意味着同一个run内可对各种表达丰度的样品进行分析。

基因检测**前沿的两种方法是:高通量测序(NGS)和数字PCR(dPCR)。高通量测序技术又称“下一代”测序技术,可以一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,功能强大,但是实验操作较复杂,数据分析难度较大,检测周期长,成本较高。数字PCR技术是目前**精细**灵敏的基因检测技术,借助微液滴或微腔室,通过单个模板分子的PCR扩增,可实现不依赖于标准曲线和参照样本的***定量。与NGS相比,数字PCR灵敏度高、检测速度快、操作简便、结果易读、成本低廉等优势使其更适合临床检测,成为精细医疗实现平民化、大众化的比较好选择。此外,数字PCR还在基因表达差异研究、拷贝数变异(CNV)研究、低丰度DNA模板分子的精确定量、甲基化含量鉴定、二代测序辅助建库、CRISPR-Cas9基因编辑结果验证、转基因成分的检测、移植排异监控、肠道菌群分析以及***基因组检测等众多领域中有着优异的应用。样本多样性,样本通量可达96个样本,支持灵活设定。

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数字PCR检测及分析原理在上世纪90年代就被提出来了,但是无奈受限于当时的技术条件,样本稀释及分配都是靠手工来完成的,受到很多因素的干扰和限制;并且结果分析对于研究者来说也十分枯燥与繁琐,因此在很长一段时间dPCR发展停滞不前。后来由于微流控技术与微纳集成制造工艺的发展解决了dPCR过程中的几个关键技术问题,推动了dPCR的研究与商业化的发展。目前根据dPCR样本稀释分配的方式,基本可分为三大类,一种是基于大规模集成微流控芯片;第二种是使用微反应室/孔板;第三种是微滴式。但不论是走芯片式还是微滴式,其基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或者微滴当中,每个反应器的核酸模板数少于1或者等于1。经过PCR扩增之后,有一个核酸分子的模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,可以推算出原始溶液的核酸浓度。采用微滴式技术高达100,000个的微滴。无锡数字PCR报价

可使用第三方PCR反应液,配备PCR A300(温度范围4°C-98°C,扩增模块温控精度±0.2°C)。上海广东数字PCR如何选型

MicroDrop-100微滴式数字PCR是具有国内自主知识产权的第三代JUE对定量PCR系统,整套系统由MicroDrop-100A微滴生成仪、MicroDrop-100B微滴检测仪以及结果数据分析设备等构成。系统通过自主设计的微流控芯片,利用油水相不兼容的原理,在2分钟时间内将PCR体系分割成100,000油包水的体系,每个体系为 的PCR反应体系,体积约为0.2nL,单次实验一次可生成8个样本的油包水体系。由于油包水体系的分割效应,使得数字PCR受PCRYi制物的影响相对较小,有利于复杂环境样本的实验操作。区别于荧光定量PCR的过程性判读方法,数字PCR结果判读为终点法,故其对PCR扩增效率的依赖也相对较小。上海广东数字PCR如何选型

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