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CircNOLC1结合蛋白质和miRNA调控结直肠AI转移

来源: 发布时间:2024-04-14

正文



结直肠AI患者常因转移而死亡,肝脏是转移的主要部位。然而,只有少数患者可接受手术切除,导致5年生存率极低。因此,迫切需要深入研究结直肠AI转移中的基因变化和调控机制,以发现新的诊疗靶点,开发更有效的抗AI疗法,提高患者的生存率和生活质量。

2023年11月,大连医科大学任双义、左云飞团队在Advanced Science(IF=15.1)上发表“CircNOLC1 Promotes Colorectal Cancer Liver Metastasis by Interacting with AZGP1 and Sponging miR-212-5p to Regulate Reprogramming of the Oxidative Pentose Phosphate Pathway”的研究文章。体内、外实验显示CircNOLC1促进结直肠癌细胞增殖、迁移和肝转移。机制研究表明circNOLC1与AZGP1相互作用以及circNOLC1/miR‐212‐5p/c‐Met轴在氧化磷酸戊糖通路介导的结直肠AI转移中发挥关键作用,可能为结直肠AI的个体化医疗提供新的靶点。

图形摘要如下:

Highlights如下:

1)circNOLC1在转移性CRC中高表达。敲减circNOLC1抑制CRC细胞的生长和肝转移。

2)circNOLC1调节G6PD水平和活性,以mTOR依赖的方式促进戊糖磷酸途径。

3)机制上,通过ChIRP-MS和RIP实验,发现circNOLC1与AZGP1互作,活化mTOR/SREBP1信号通路,此外,anti-AGO2 IP实验还发现circNOLC1吸附miR‐212‐5p上调c‐Met表达,二者均可诱导G6PD活化氧化磷酸戊糖通路在结直肠AI肝转移中发挥作用。另外,ChIP实验证实YY1可调控circNOLC1表达。


临床相关性:

circNOLC1在转移性CRC中表达水平高于非转移CRC,在CRC表达水平高于正常组织。

功能研究:

circNOLC1敲减抑制结直肠癌细胞的增殖和转移,动物模型结果显示,circNOLC1敲减抑制PDO生长,裸鼠肝脏转移,提高生存率。过表达circNOLC1则结果相反。

机制研究:

据报道circNOLC1亲本基因NOLC1与代谢有关,为了探索circNOLC1机制,进行转录组学和代谢组学,综合富集分析表明,circNOLC1敲低导致氧化磷酸戊糖途径(oxPPP)代谢通路、代谢物、关键基因发生变化(图1a-c)。G6PD是oxPPP的限速酶,细胞和动物实验结果表明,circNOLC1增强mTOR、G6PD活性,oxPPP重编程和CRC细胞的肝转移潜能(图1d-e)。

图1 circNOLC1调节G6PD水平和活性,以mTOR依赖的方式促进戊糖磷酸途径(Ref. Fig3)

研究表明,circrna可与蛋白质相互作用形成circRNPs,影响相关蛋白质的功能。为了探索circNOLC1诱导oxPPP代谢的分子机制,鉴定潜在的circNOLC1互作蛋白,结合ChIRP-MSRNA pulldown-WB实验,发现AZGP1, DSG1和KRT16证明与circNOLC1存在互作(图2a-c)。因AZGP1在CRC中高表达,且在葡萄糖代谢中发挥重要作用,故将其作为研究对象。RIP实验发现circNOLC1在anti-AZGP1下拉物中富集(图2d)。为了确定circNOLC1与AZGP1互作区域,设计circNOLC1缺失突变体,进行RNA pulldown实验,表明circNOLC1的nt 91-150是circNOLC1与AZGP1相互作用必需的(图2e)。

进一步检测发现,circNOLC1调控AZGP1蛋白水平,用蛋白酶体抑制剂处理细胞显示MG132显著提高AZGP1蛋白水平,暗示circNOLC1阻碍AZGP1蛋白降解(图2f)。此外,功能回复实验结果表明circNOLC1通过AZGP1活化mTOR/SREBP/G6PD信号通路来增强PPP(图2g和h)。

图2 circNOLC1通过与AZGP1互作影响葡萄糖摄取和mTOR/SREBP/G6PD信号(Ref. Fig4)

鉴于circrna通常作为miRNA海绵发挥作用,研究了circNOLC1是否可以在CRC进展过程中与miRNA结合。Anti-AGO2 IP分析发现circNOLC1富集(图3a)。通过生物信息学分析,发现有7个潜在的miRNA可与circNOLC1结合,其中miR-212-5p是一个报道与CRC转移相关的AI抑制因子,其表达水平在CRC细胞系中下调。circRIP实验发现circNOLC1和miR‐212‐5p在复合物中特异性富集,与生物素偶联的miRNA pull-down结果一致(图3b-c)。双荧光素酶实验结果也证实二者存在结合(图3d)。进一步实验显示抑制miR‐212‐5p上调c‐Met表达水平。

接下来,评估了circNOLC1在CRC中上调的原因。三个数据库预测均发现NOLC1启动子包含YY1的结合基序(图3e)。ChIP分析验证了YY1与NOLC1启动子直接结合(图3f),YY1上调circNOLC1水平(图3g);同时circNOLC1促进HuR的表达部分增强了NOLC1 mRNA的稳定性(图3h-i)。

图3 circNOLC1作为miR‐212‐5p的海绵,上调c‐Met促进结直肠AI肝转移,YY1上调circNOLC1表达,circNOLC1通过HuR稳定NOLC1 mRNA(Ref. Fig5/6)

结论:本研究发现CircNOLC1促进结直肠癌细胞的增殖、迁移和肝转移。机制上,CircNOLC1兼具circRNP和ceRNA功能,一方面,circNOLC1与AZGP1互作,活化mTOR/SREBP1信号通路,另一方面,circNOLC1吸附miR‐212‐5p上调c‐Met表达,诱导G6PD活化,在氧化戊糖磷酸途径介导的结直肠AI肝转移中发挥关键作用,可能为结直肠AI的个体化医疗提供新的靶点。另外,YY1可上调circNOLC1表达,circNOLC1促进HuR的表达增强NOLC1 mRNA的稳定性。

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