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FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

来源: 发布时间:2024年05月15日

用于IgA1和IgA2m1以上铰链消化的冻干酶。与IdeS不同,Genovis提供的IgASAPSub1+2在铰链上方的一个特定位点消化人IgA1和IgA2m1,产生完整且均匀的Fab和Fc片段。由于人IgA1的铰链比IgA2的铰链长,因此IgA1和IgA2m1之间来自消化位点的氨基酸C末端不同。IgASAPSub1+2可消化分泌物和血清IgA。孵育时间为过夜(16-18小时),并且由于酶的特异性,没有过度消化的风险。该酶在pH值为6.0至8.0时具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可产生活性。活性为37°C。IgASAPSub1+2是从丹毒梭菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为131kDa。IgASAPSub1+2冻干剂以冻干粉的形式提供,装在1000个单位的小瓶中,用于消化1mgIgA1和IgA2m1。Genovis将半胱氨酸蛋白酶FabRICATOR(IdeS)固定在磁性琼脂糖珠上,现在称为FabRICATOR MagIC。FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

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LC-MS中级分析是一种被大众接受的分析方法,用于快速表征mAb和其他基于IgG的生物制药。它有助于理解多种关键质量属性 (CQA),例如糖基化、氧化和 C 端赖氨酸剪切。这种关于翻译后修饰(PTM)的详细知识是生物制药开发和制造所必需的。Genovis的FabRICATOR HPLC酶色谱柱,可快速进行单克隆抗体的柱上酶切,并产生一致的亚基。该色谱柱含有固定化的FabRICATOR(IdeS)酶,可在铰链下方快速且特异性地消化IgG,产生F(ab')2和Fc片段,而不会出现任何过度消化的风险。为了减少样品处理并为样品制备提供自动化解决方案,FabRICATOR被共价固定在树脂上,并装在适用于HPLC的PEEK色谱柱硬件中。使用FabRICATOR HPLC色谱柱,只需稍作修改,即可使用标准HPLC-MS装置自动生成抗体亚基。然后,FabRICATOR HPLC色谱柱上消解产生的亚基被捕获在在线连接的反相(RP)色谱柱的柱头上。浙江FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学如FabRICATOR Immobilized,可快速轻松地生成均质 F(ab')2 和 Fc/2 片段。

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对于涉及完整Fab或Fc抗体片段的应用,需要在抗体铰链处进行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等传统酶可用于生成 Fab 片段,但非特异性酶活性需要仔细优化,以极大限度地降低多个消化位点的风险。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一个消化位点,可从人 IgG1 生成均质的 Fab 和 Fc 抗体片段。生成的片段可用于结晶和高阶结构 (HOS) 的 NMR 研究、结合研究等。在这里,我们提出了获得完整Fab和Fc抗体片段的不同策略。所得片段显示 GingisKHAN 的有效消化,用于生成完整的 Fab 片段或从依那西普上的融合 TNFR 结构域中分离 Fc。由于 GingisKHAN 的特异性消化依赖于 IgG 的天然折叠,因此在变性条件下特异性受到负面影响。为了使用SDS-PAGE分析消解效率,在加入SDS上样缓冲液之前,停止在分析样品中加入碘乙酰胺的反应。Genovis同时提供IdeS酶的纯化试剂盒。

Genovis除了提供IdeS酶以外,还提供很多种特异性蛋白酶,如半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA (IgdE)。IgdE 在铰链正上方的一个特定位点消化人 IgG1,产生完整的 Fab 和 Fc 片段的均质池。它在pH值和盐浓度范围内具有活性,不需要任何还原剂或辅助因子。因此,与许多其他常用的蛋白酶相比,FabALACTICA不需要任何优化来避免过度消化。这使得FabALACTICA成为一种有吸引力的酶,例如在还原和非还原条件下的LC-MS分析、抗体高阶结构(HOS)的结晶和NMR研究、双特异性或多特异性抗体的表征、单价结合研究和完整的Fc聚糖分析。Genovis的IgASAP 是 IgA 消化酶家族。

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与IdeS不同,Genovis的IgMBRAZOR是一种独特的IgM特异性蛋白酶,可在重链中CH2结构域下方的一个特定位点消化人IgM,产生均质的F(ab')2和Fc片段。该酶能够对复杂和高分子量的人IgM进行中级分析,从而促进疫苗、zhiliao和诊断等过程中的IgM表征。独特-可实现IgM的中级表征和质量控制;快速–在30分钟内生成均匀的F(ab')2和Fc片段;高度特异性–人IgM重链中的一个消化位点。IgMBRAZOR是一种独特的IgM特异性酶,可在重链中CH2结构域下方的一个特定位点消化人IgM,产生F(ab')2和Fc片段。消化在30分钟内完成,并且由于酶的特异性,如果孵育时间延长,则不存在过度消化的风险。该酶在pH值为5.5至9.0时具有活性,不需要还原条件或辅助因子即可发挥活性。良好的活性是在37°C下,但也可以在室温下使用增加孵育时间进行消化。IgMBRAZOR在大肠杆菌中表达。该酶含有His标签,分子量为38kDa。IgASAP Sub1 可水解分泌物和血清 IgA1。湖北IdeS蛋白酶蛋白组学

QC方法需要执行简单,易于训练,高度可重复,数据易于分析。FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。FabRICATORIdeS蛋白酶蛋白组学

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