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宁波单细胞多组学

来源: 发布时间:2022年08月13日

对于单细胞测序而言,常常需要先构建细胞图谱,在此基础上再开展后续各项分析,并且数据分析时以细胞聚类(cell cluster)为讨论对象,而不是像常规Bulk测序一样以组别为分析对象,因此单细胞测序项目对样本入组要求没有Bulk测序那样严格,但是单细胞测序,特别是目的为图谱研究时,需要通过提高样本复杂度(增加样本数),尽可能的构建某一疾病类型、群体细胞图谱信息。因此,单细胞测序实验设计时首先需要保证生物学重复,不同样本来源的样本建议单独进行细胞解离和捕获、建库、测序,以保证捕获到足够的细胞数,单个样本分别捕获细胞时,后续分析除了整体分析以外,还可以做单样本分析,保证分析的完备准确性。在单细胞转录组领域,将转录组与蛋白质结合的代表性例子只有单细 胞RNA测序方法。宁波单细胞多组学

单细胞技术让我们在基因组学、表观基因组学、转录组学和蛋白质组学等层面上解析了许多错综复杂的生命密码。随着科技的进步,我们发现整合多个组学的信息可以更仔细地观察细胞之间的可变性,更清楚地识别特定细胞及其功能。单细胞多组学在临床诊断、疾病分型以及细胞发展机制这些重大生命科学领域方面的应用也将越来越广。单细胞技术从 2009 年发展到现在,研究范围不再局限于转录组,而是扩展到了基因组、免疫组、表观组、蛋白组等多组学水平。宁波BD Rhapsody单细胞多组学平台目前已应用的单细胞多组学联合分析包括转录组和基因组,转录组和DNA甲基化、转录组和蛋白组。

单细胞测序技术(SingleCellSequencing)从一种新兴的研究角度,借助已有的高通量测序手段,帮助研究者在疾病样本的异质性、样本微环境、发育学、免疫学以及其他领域中进行单细胞层面的数据解析,解决了BulkPopulationSequencing所无法解决的问题。这样一个新的研究领域必然也需要足够可靠的实验手段来支撑。BDRhapsody单细胞分选系统为此提供了完善的硬件设备,保证了从单细胞悬液质量评估到单细胞分选标记过程中每一个实验步骤的完善质控。NovelBio单细胞实验团队借助BDRhapsody单细胞分选系统,在实验实施层面对单细胞测序结果的可靠性提供了强有力的保证。继单细胞悬液制备之后,又在另一道关键关卡提供了可靠的支持,帮助研究者在单细胞测序领域收获更多的成果。

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题,BD和10X这两个平台普遍提供的细胞数量都在1-6K不等的测序细胞量,这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的SingleCell群体类型。因此,这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上,无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说,都会更实用。同时依托RandomCellLabel技术,使得其对于NovaSeq、HiSeqXTen、Hiseq4000等设备存在的Indexhooping现象,相对于Smart-Seq数据来说,影响几乎可以忽略不计(10XGenomics官方网站曾给出hooping测试结果,显示无影响。烈冰测序服务已助力300余篇国际主流期刊研究文章发表。

单细胞多组学测序技术是在单细胞分辨率下精确分析细胞异质性和基因调控网络的新技术,提供了全新的视角来分析细胞的分化路径、细胞间的交互调控和细胞亚群的分离现象。转录组、表观基因组、蛋白组学和代谢组学的差异赋予了组织内同样基因组背景下的单个细胞的功能特异性。单个细胞的组学变化决定了组织的功能状态,因此,阐明组织的细胞异质性是破译生理功能和病理演变的关键。然而,以bulkRNA测序等为**的传统方法掩盖了细胞的异质性,细胞组学变化的平均水平。近10年来,单细胞组学技术应运而生,实现了在单细胞分辨率下研究分子的变化规律。功能研究型单细胞多组学测序技术结合了CRISPR基因编辑技术, 深度挖掘基因表达调控与细胞功能。宁波single cell RNA单细胞多组学数据分析

单细胞多组学技术(single-cell multimodal omics) 是指在同一细胞中同时测量多种组学数据的前沿技术。宁波单细胞多组学

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