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温州BD空间转录组多组学测序

来源: 发布时间:2022年09月11日

多样本数据合并:FractionofReadsKept:合并样本时,各样本根据MappedBarcodedReadsperCell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大,需要进行Downsample处理,以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平,从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深入解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!空间转录组测序技术提供了空间转录组水平下的科学研究视角。温州BD空间转录组多组学测序

烈冰提供空间转录组全流程服务,包括样本包埋、贴片、选片、HE染色、拍照成像、组织透化、建库测序以及后续的FISH验证等各个步骤,为您提供无忧服务。烈冰搭建了以莱卡CM1950冷冻切片机、尼康多荧光通路全自动扫描显微镜、3Dhistech-midi数字扫描仪为基础的先进实验平台,并制定严格规范的实验室SOP,经过大量的切片、贴片实操演练,对不同类型组织的切片厚度、温度进行优化,确保获得更好质量的冷冻切片。利用NovelBrain云分析平台,搭建0代码需求的空间转录组分析流程,准确快速解析空间转录组数据。取同一样本组织的相邻区域进行单细胞转录组测序,通过单细胞转录组数据和空间转录组数据的整合分析,判定空间区域内的细胞类别,精确解析组织空间内的异质化信息。武汉烈冰生物空间转录组测序服务空间转录组测序,上海烈冰生物科技很靠谱。

10XVisium的实验主要分为两部分:组织学板块和组学板块。组织学板块包括样品的包埋、切片、固定、染色及成像,记录切片的形态学信息;组学板块包括cDNA的合成、扩增、接头连接和测序,记录切片的转录本信息和空间位置信息。具体实验流程如下:A、切片制备和优化:取新鲜组织、冷冻、切片,并进行HE染色成像,优化确定切片是否覆盖靶向区域。B、切片固定和透化:将组织切片放置在含有与RNA结合捕获探针的载玻片上,并进行固定和透化,使细胞中的mRNA得到释放,并结合到相应的捕获探针上,从而获取基因表达信息。C、逆转和文库构建:以捕获的RNA为模板,进行cDNA合成,和测序文库制备。D、高通量上机测序:对制备好的测序文库,进行二代高通量短读长测序。E、数据可视化分析:结合HE结果,确定哪些基因有表达,表达量高低,以及这些基因的空间位置信息

烈冰生物已空间转录组测序服务提供从一个组织切片样本中获取包括空间信息在内的全部转录组数据,从而可以区分和定位功能基因在特定组织区域内的活跃表达。其可以检测组织样本中的所有基因活动,并绘制活动发生的位置,这将有助于科学家更好地构建生物图谱,并进一步理解疾病和生物学过程。目前,空间转录组主要应用于多种疾病、免疫、发育、神经和病理学等研究领域。烈冰生物具有专业的实验团队、丰富的切片经验,配置了国际主流的仪器设备,实验团队针对不同组织类型优化完善实验方案,并制定了严谨规范的实验室SOP流程,保证空间转录组切片的质量,全优保障测序数据质量。烈冰斥巨资引进Novaseq6000,开启更大通量测序新纪元。

空间转录组测序是在组织原位检测全转录组基因表达的⼀种技术,可以展⽰组织切⽚中不同区域的基因表达情况,同时能够得到⽬的基因在组织内部的空间位置信息。与传统的全基因转录组或单细胞转录组测序相⽐,空间转录组测序浆病理影像(H&E染⾊)与测序数据映射在⼀起,进⽽可以分析组织切内部空间结构的细胞异质性。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境,将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学等领域的研究利器。烈冰空间转录组,多平台任意选择,随心组合,优化您的科学研究,助力探索新的科学视角。上海scRNA空间转录组测序服务

空间转录组测序技术遍地开花,烈冰服务让您的生物医学研究如虎添翼。温州BD空间转录组多组学测序

烈冰生物真正实现空间转录组测序的全程把控,做到从实验设计、空间信息标记、建库测序、定制化分析的全流程一站式服务,助力高分文章发表;专业实验团队保证样本的高度一致性;专业的生物学团队提供个性化的产品应用场景解读、保持对生物学意义的关注;强大的生信分析团队一对一地进行详实科学的实验方案设计并提供多次售后分析;可接受样品类别为冰冻组织:新鲜样本经液氮预冷的异戊烷速冻,-80℃保存OCT包埋组织:新鲜组织异戊烷速冻后进行OCT包埋,或新鲜组织直接OCT包埋后-80℃速冻,注意标明样本方向,样本于-80℃保存样本处理和运输过程需要在低温环境温州BD空间转录组多组学测序

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